安装lammps

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安装lammps

2023-06-15 15:59| 来源: 网络整理| 查看: 265

安装lammps

安装centos7系统的时候对硬盘分区：/-50G /var-50G /boot-10G /home-150G /biosboot-2G /swp-64G

一：安装fftw： 1、在lammps文件夹下 mkdir fftw3 2、在解压后的文件夹fftw-3.3.8中输入

su(不然没法shared) ./configure --prefix=/home/hou/lammps/fftw3 --enable-shared=yes （不shared不能建立lammps共享库） make -j8 make install

二：安装mpich： 1、在lammps文件夹下 mkdir mpich3 2、在解压后的文件夹mpich-3.3中输入

./configure --prefix=/home/hou/lammps/mpich3 --enable-shared make -j8 make install

三：设置fftw和mpich的环境变量： 1、在桌面中输入

vi .bashrc i(插入) 在文件最后插入 export PATH=/home/hou/lammps/fftw3/bin:/home/hou/lammps/mpich3/bin:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=/home/hou/lammps/fftw3/lib:/home/hou/lammps/mpich3/lib:$LD_LIBRARY_PATH Esc(退出编辑) :wq(退出文件) source .bashrc(更新bashrc文件) echo $PATH(验证) mpirun -np 2 gedit(测试mpich)

四：安装lammps：把lammps压缩包解压后的lammps-install文件夹复制到lammps文件夹下进入lammps-install中的src中查找MAKE文件夹中的Makefile.mpi文件，修改编译器和路径，如下

把开头两个mpicxx换成g++ MPI_INC = -DMPICH_SKIP_MPICXX -I/home/hou/lammps/mpich3/include MPI_PATH = -L/home/hou/lammps/mpich3/lib MPI_LIB = -lmpich -lmpl -lpthread FFT_INC = -DFFT_FFTW3 -I/home/hou/lammps/fftw3/include FFT_PATH = -L/home/hou/lammps/fftw3/lib FFT_LIB = -lfftw3

修改后返回src文件夹中开始安装，输入下面的命令

make yes-all make no-lib make mpi -j8

设置环境变量：在lammps-install文件夹下新建文件夹bin：mkdir bin 把src中生成的lmp_mpi复制到bin中在桌面：

vi .bashrc i export PATH=/home/hou/lammps/lammps-install/bin:$PATH Esc :wq source .bashrc lmp_mpi

输入lmp_mpi可以看到版本号，说明设置成功

基本参考b站up 埃爱慕阿Super，链接为https://space.bilibili.com/389751075/

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